Critères de classification dans le règne végétal :


1. Selon les méthodes de reproduction :
      - Phanérogames : végétaux supérieurs : organes de reproduction visibles (fleurs)
      - Cryptogames : organes de reproduction non visibles : les algues sont des végétaux inférieurs


2.Existence ou non d'organes :
      - Cormophytes : organes distincts (tiges, feuilles, racines)
      - Thallophytes : organisation cellulaire continue : les algues possèdent des crampons et non des racines; pas de tiges ni de feuilles mais une lame ou un cylindre


3. Exitence ou non de vaisseaux conduisant la sève
      - Végétaux vasculaires
      - Végétaux non vasculaires : les algues ne possèdent pas de vaisseaux pour conduire la sève
      - Photoautotrophes : se nourrissent d'énergie lumineuse : possèdent des pigments capteurs d'énergie lumineuse.


4.Classification des algues selon les pigments :
Les pigments sont à la base de la classification des algues. Ils captent l'énergie lumineuse et les transfèrent sur la chlorophylle A. La différence de pigmentation s'explique par la différence de pénétration de la lumière dans l'eau de mer en s'enfonçant.

      - Végétaux chlorophylliens :
            - Chlorophylle A seule --> Algues vertes : Chlorophyceae
            - Chlorophylle A + biliprotéines + phycoérythrines --> Algues rouges : Rhodophyceae
            - Chlorophylle A + biliprotéines + phycocyanines --> Algues bleues : Cyanophyceae
            - Chlorophylle A + xanthophylle (jaunes) (fucoxanthine) --> Algues brunes : Phaeophyceae


5. Selon l'habitat :
      - Algues d'eau douce ou Algues marines


6. Selon l'organisation du thalle
      - Thalle unicellulaire (microphyte) ou Thalle pluricellulaire (macrophyte)